Neste estudo de caso, faremos a comparação entre duas sequências de DNA: (1) ser humano; vs. (2) bactéria.
Estrutura do DNA. Fonte: https://se.wikipedia.org/wiki/Fiila:Dna-base-flipping.svg
DNA é uma molécula presente em todos os seres vivos, que é responsável por armazenar as características hereditárias. Ela é composta por sequências de nucleotídeos, que podem de quatro tipos: adenina, timina, citosina ou guanina.
Neste estudo de caso, queremos avaliar se estruturas com funções parecidas (estamos usando sequências de RNA ribossomal) de organismos diferentes têm diferenças. Para isso vamos avaliar a quantidade de pares de nucleotídeos.
Dados utilizados:
Human 18S rRNA gene, complete
Fonte: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/M10098.1?report=fasta
Escherichia coli strain U 5/41 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Fonte: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NR_024570.1?report=fasta
Como resultado final, geraremos uma figura que compara os DNAs visualmente.
Dados utilizados estão disponíveis em anexo nesta aula.